Biologia
Małopolski Konkurs Biologiczny - chemizm życia, metabolizm i genetyka
Pierwiastki i związki budujące organizmy, enzymy i ATP, fotosynteza, oddychanie komórkowe i fermentacje, a dalej replikacja DNA, transkrypcja, translacja, kod genetyczny, mutacje i choroby genetyczne. Do tego krzyżówki genetyczne z prawdopodobieństwem oraz prawo Hardy'ego-Weinberga. Zestaw dla uczniów szkoły podstawowej przygotowujących się do konkursu biologicznego w województwie małopolskim.
Podcast
Ładuję…
1.Pierwiastki biogenne i makroelementy
Pierwiastki biogenne to sześć pierwiastków budujących związki organiczne: węgiel (C), wodór (H), tlen (O), azot (N), fosfor (P) i siarka (S). Węgiel tworzy szkielety związków organicznych, azot wchodzi w skład białek i kwasów nukleinowych, fosfor - kwasów nukleinowych, ATP i fosfolipidów, siarka - niektórych aminokwasów. Makroelementy to pierwiastki potrzebne w dużych ilościach: biogenne oraz wapń (Ca - kości, zęby, krzepnięcie krwi), magnez (Mg - składnik chlorofilu), potas (K) i sód (Na) - przewodzenie impulsów nerwowych, chlor (Cl) - składnik kwasu solnego w żołądku.
2.Mikroelementy: żelazo (Fe), jod (I), fluor (F)
Mikroelementy to pierwiastki potrzebne organizmowi w bardzo małych ilościach, ale niezbędne. Żelazo (Fe) wchodzi w skład hemoglobiny w krwinkach czerwonych i mioglobiny w mięśniach - białek wiążących tlen; jego niedobór prowadzi do niedokrwistości (anemii) z osłabieniem i bladością. Jod (I) jest składnikiem hormonów tarczycy, np. tyroksyny, regulujących tempo metabolizmu; jego niedobór może powodować powiększenie tarczycy (wole), dlatego sól kuchenną się joduje. Fluor (F) wzmacnia szkliwo zębów i kości, a jego niedobór sprzyja próchnicy. Mikroelementami są też m.in. cynk, miedź i mangan.
3.Woda - właściwości i znaczenie dla organizmów
Cząsteczka wody jest polarna (ma biegun dodatni i ujemny), a sąsiednie cząsteczki łączą się wiązaniami wodorowymi. Stąd właściwości wody: 1) jest dobrym rozpuszczalnikiem - środowiskiem reakcji i środkiem transportu substancji; 2) ma duże ciepło właściwe - wolno się nagrzewa i stygnie, więc łagodzi wahania temperatury; 3) ma duże ciepło parowania - parujący pot chłodzi ciało; 4) duża spójność (kohezja) i przyleganie (adhezja) pozwalają jej wznosić się w naczyniach roślin; 5) ma duże napięcie powierzchniowe; 6) lód ma mniejszą gęstość niż woda ciekła, więc pływa - zbiorniki zamarzają od góry.
4.Monosacharydy i disacharydy, wiązanie glikozydowe
Monosacharydy, czyli cukry proste: glukoza - główne paliwo komórek, fruktoza - cukier owocowy, galaktoza - składnik cukru mlecznego (wszystkie trzy mają wzór ) oraz cukry pięciowęglowe: ryboza (w RNA i ATP) i deoksyryboza (w DNA). Dwa cukry proste łączy wiązanie glikozydowe - powstaje disacharyd (dwucukier) i cząsteczka wody. Disacharydy: sacharoza - z glukozy i fruktozy (cukier z buraków i trzciny), laktoza - z glukozy i galaktozy (cukier mleczny), maltoza - z dwóch cząsteczek glukozy (cukier słodowy). Cukry proste i dwucukry są słodkie i dobrze rozpuszczają się w wodzie.
5.Polisacharydy: skrobia, glikogen, celuloza, chityna; wykrywanie skrobi
Polisacharydy (wielocukry) to długie łańcuchy cukrów prostych połączonych wiązaniami glikozydowymi. Skrobia - materiał zapasowy roślin (bulwy, nasiona), zbudowana z glukozy połączonej wiązaniami α-glikozydowymi. Glikogen - materiał zapasowy zwierząt i grzybów (u człowieka w wątrobie i mięśniach), też z glukozy z wiązaniami α, silnie rozgałęziony. Celuloza - budulec ścian komórkowych roślin; glukozę łączą w niej wiązania β-glikozydowe, których enzymy człowieka nie rozkładają. Chityna - budulec pancerzy stawonogów i ścian komórkowych grzybów. Skrobię wykrywa płyn Lugola: barwi ją na granatowo.
6.Białka: aminokwasy, wiązanie peptydowe i struktury I-IV rzędu
Białka są zbudowane z aminokwasów (20 podstawowych rodzajów). Każdy aminokwas ma grupę aminową (), grupę karboksylową () i łańcuch boczny, którym różni się od pozostałych. Aminokwasy łączy wiązanie peptydowe: powstaje między grupą karboksylową jednego a aminową drugiego, z wydzieleniem cząsteczki wody. Struktura I-rzędowa to kolejność aminokwasów w łańcuchu. II-rzędowa - regularne zwinięcie łańcucha w α-helisę lub β-harmonijkę, utrzymywane wiązaniami wodorowymi. III-rzędowa - przestrzenny kształt całego łańcucha. IV-rzędowa - połączenie kilku łańcuchów w jedną cząsteczkę.
7.Białka proste i złożone; denaturacja i koagulacja
Białka proste składają się tylko z aminokwasów: albuminy (osocze krwi, białko jaja), globuliny (m.in. odporność), histony (nawija się na nie DNA), kolagen (skóra, ścięgna, kości), keratyna (włosy, paznokcie). Białka złożone mają też składnik niebiałkowy: hemoglobina (z hemem - przenosi tlen we krwi), mioglobina (magazynuje tlen w mięśniach). Denaturacja - zwykle nieodwracalne zniszczenie struktury przestrzennej białka, np. przez wysoką temperaturę, kwasy lub sole metali ciężkich; białko traci funkcję. Koagulacja - wytrącanie się białka z roztworu, np. przez sól kuchenną; bywa odwracalna.
8.Lipidy: tłuszcze właściwe, fosfolipidy, cholesterol
Lipidy nie rozpuszczają się w wodzie. Lipidy proste to tłuszcze właściwe i woski. Tłuszcz właściwy to glicerol i trzy kwasy tłuszczowe; każdy z nich łączy z glicerolem wiązanie estrowe. Tłuszcze to materiał zapasowy i izolacja cieplna. Lipidy złożone mają dodatkowy składnik: fosfolipidy zawierają resztę fosforanową, mają hydrofilową „głowę” i dwa hydrofobowe „ogony”, dlatego tworzą dwuwarstwę błon komórkowych. Steroidy mają budowę pierścieniową, np. cholesterol - składnik błon komórek zwierzęcych i surowiec do wytwarzania hormonów płciowych i witaminy D. Tłuszcze wykrywa barwnik Sudan III.
9.Kwasy nukleinowe: nukleotyd, DNA i RNA, komplementarność zasad
Kwasy nukleinowe to łańcuchy nukleotydów. Nukleotyd składa się z cukru, reszty fosforanowej i zasady azotowej. DNA: cukier deoksyryboza; zasady azotowe: adenina (A), tymina (T), guanina (G), cytozyna (C); dwie nici tworzą helisę. Zasady obu nici łączą wiązania wodorowe zgodnie z regułą komplementarności: A z T (dwa wiązania), G z C (trzy wiązania). DNA przechowuje informację genetyczną. RNA: cukier ryboza, zamiast tyminy uracyl (U), zwykle jedna nić. Rodzaje RNA: mRNA (informacyjny - przepis na białko), tRNA (transportujący - nosi aminokwasy), rRNA (rybosomowy - buduje rybosomy).
10.Metabolizm: anabolizm i katabolizm, szlak i cykl metaboliczny
Metabolizm to całość reakcji chemicznych organizmu. Anabolizm - reakcje syntezy: ze związków prostych powstają złożone, co wymaga energii (np. fotosynteza, synteza białek). Katabolizm - reakcje rozkładu: związki złożone rozpadają się na prostsze i uwalnia się energia (np. oddychanie komórkowe, fermentacja). Oba łączy ATP: energia z katabolizmu napędza anabolizm. Szlak metaboliczny to ciąg reakcji, w którym produkt jednej jest substratem następnej (np. glikoliza). Cykl metaboliczny to szlak zamknięty: na końcu odtwarza się związek, od którego ciąg się zaczął (np. cykl Krebsa).
11.ATP i przenośniki elektronów: NAD+, FAD, NADP+
ATP (adenozynotrifosforan) to uniwersalny przenośnik energii. Jest nukleotydem: adenina, ryboza i trzy reszty fosforanowe połączone wiązaniami wysokoenergetycznymi. Odłączenie jednej reszty (z ATP powstaje ADP i fosforan) uwalnia energię do pracy komórki. ATP odtwarza się w fosforylacji: substratowej (resztę fosforanową oddaje związek organiczny, np. w glikolizie), oksydacyjnej (w łańcuchu oddechowym, z udziałem tlenu) lub fotosyntetycznej (dzięki światłu). NAD+ i FAD przenoszą elektrony i wodór w oddychaniu komórkowym (jako NADH i ), a NADP+ - w fotosyntezie (jako NADPH).
12.Enzymy: centrum aktywne, swoistość substratowa, kataliza
Enzymy to biologiczne katalizatory, prawie zawsze białka. Przyspieszają reakcje, bo obniżają energię aktywacji (energię potrzebną do rozpoczęcia reakcji); same się nie zużywają. Enzym ma centrum aktywne - zagłębienie, do którego pasuje substrat. Kataliza enzymatyczna: enzym łączy się z substratem w kompleks enzym-substrat, substrat przekształca się w produkt, a uwolniony enzym może działać ponownie. Swoistość substratowa: enzym działa tylko na określony substrat (lub grupę podobnych), bo kształt centrum aktywnego odpowiada kształtowi substratu - np. amylaza rozkłada skrobię, ale nie białka.
13.Wpływ temperatury, pH i stężenia substratu na enzymy; katalaza
Temperatura: gdy rośnie, reakcja przyspiesza - aż do temperatury optymalnej (u człowieka zwykle około 37°C). Powyżej niej białko enzymu ulega denaturacji i aktywność gwałtownie spada. Chłód spowalnia enzym, ale go nie niszczy. pH: każdy enzym ma swoje optimum - pepsyna w żołądku około 2, trypsyna w jelicie około 8. Stężenie substratu: im większe, tym szybsza reakcja, ale tylko do wysycenia enzymu - gdy wszystkie centra aktywne są zajęte, szybkość już nie rośnie. Katalaza (np. w ziemniaku i wątrobie) rozkłada nadtlenek wodoru na wodę i tlen - w doświadczeniu widać pienienie.
14.Regulacja enzymów: aktywacja, inhibicja, sprzężenie zwrotne ujemne
Aktywacja - zwiększenie aktywności enzymu przez aktywator, np. jony niektórych metali; nieczynny pepsynogen zmienia się w czynną pepsynę pod wpływem kwasu solnego. Inhibicja - hamowanie enzymu przez inhibitor. Inhibitor kompetycyjny przypomina substrat i konkuruje z nim o centrum aktywne; niekompetycyjny przyłącza się w innym miejscu enzymu i zmienia kształt centrum aktywnego. Sprzężenie zwrotne ujemne reguluje cały szlak metaboliczny: gdy końcowego produktu jest dużo, hamuje on enzym z początku szlaku i produkcja zwalnia; gdy produktu ubywa, hamowanie ustaje.
15.Fotosynteza: chloroplast, barwniki i równanie sumaryczne
Fotosynteza to wytwarzanie cukru z dwutlenku węgla i wody dzięki energii światła; produktem ubocznym jest tlen: . U roślin zachodzi w chloroplastach. Chloroplast otaczają dwie błony; wnętrze wypełnia stroma, a w niej leżą tylakoidy - spłaszczone pęcherzyki ułożone w stosy (grana). W błonach tylakoidów są barwniki fotosyntetyczne: zielone chlorofile, które pochłaniają głównie światło czerwone i niebieskie, oraz pomocnicze, żółtopomarańczowe karotenoidy. Światło zielone chlorofil w większości odbija - dlatego liście są zielone.
16.Faza zależna i niezależna od światła, siła asymilacyjna
Faza zależna od światła (jasna) zachodzi w błonach tylakoidów. Barwniki zebrane w fotosystemach pochłaniają światło, a jego energia służy do rozkładu wody (fotoliza): powstają tlen, elektrony i jony wodoru. Dzięki nim powstają ATP i NADPH (z NADP+) - razem to siła asymilacyjna. Faza niezależna od światła (ciemna), czyli cykl Calvina, zachodzi w stromie. Dwutlenek węgla zostaje przyłączony do związku organicznego i zredukowany do cukru; zużywa to ATP (energia) i NADPH (wodór i elektrony) z fazy jasnej. Tlen uwalniany w fotosyntezie pochodzi więc z wody, a nie z dwutlenku węgla.
17.Chemosynteza
Chemosynteza to sposób samożywności niektórych bakterii. Tak jak w fotosyntezie z dwutlenku węgla powstają związki organiczne, ale energia nie pochodzi ze światła (chlorofil nie jest potrzebny), tylko z utleniania prostych związków nieorganicznych. Bakterie nitryfikacyjne żyją w glebie: jedne utleniają amoniak do azotynów (np. Nitrosomonas), inne azotyny do azotanów (np. Nitrobacter) - wzbogacają glebę w azotany dostępne dla roślin. Bakterie siarkowe utleniają siarkowodór lub siarkę, żelazowe - związki żelaza, a wodorowe - wodór. Chemosynteza jest ważna w obiegu azotu i siarki w przyrodzie.
18.Oddychanie tlenowe: glikoliza, reakcja pomostowa, cykl Krebsa, łańcuch oddechowy
Oddychanie tlenowe to stopniowe utlenianie glukozy: + energia (ATP). 1) Glikoliza - w cytozolu, bez tlenu: z glukozy powstają 2 cząsteczki pirogronianu, zysk 2 ATP i NADH. 2) Reakcja pomostowa - w macierzy mitochondrium: pirogronian zmienia się w acetylo-CoA, odłącza się . 3) Cykl Krebsa - w macierzy: powstają , NADH, i niewiele ATP. 4) Łańcuch oddechowy - na wewnętrznej błonie mitochondrium: elektrony z NADH i trafiają na tlen, powstaje woda i najwięcej ATP. Razem około 30-32 cząsteczek ATP z jednej glukozy.
19.Fermentacja mleczanowa i alkoholowa
Fermentacja to beztlenowe uzyskiwanie energii z glukozy. Zachodzi w cytozolu i zaczyna się glikolizą: z glukozy powstają 2 cząsteczki pirogronianu, zysk 2 ATP. Potem pirogronian jest przekształcany tak, by odtworzyć NAD+ potrzebny do dalszej glikolizy - ATP już nie przybywa. Fermentacja mleczanowa: z pirogronianu powstaje kwas mlekowy (mleczan); prowadzą ją bakterie mlekowe (jogurt, kiszonki) i mięśnie człowieka przy dużym wysiłku. Fermentacja alkoholowa: z pirogronianu powstają etanol i dwutlenek węgla; prowadzą ją drożdże (wyrastanie ciasta). Zysk to tylko 2 ATP z cząsteczki glukozy.
20.Glikogenogeneza, glikogenoliza i glukoneogeneza
Stężenie glukozy we krwi regulują trzy procesy zachodzące głównie w wątrobie. Glikogenogeneza - synteza glikogenu z glukozy, gdy cukru we krwi jest dużo, np. po posiłku; pobudza ją insulina, hormon trzustki obniżający stężenie glukozy we krwi. Glikogenoliza - rozkład glikogenu do glukozy, gdy cukru ubywa, np. między posiłkami i podczas wysiłku; pobudza ją glukagon, hormon trzustki działający przeciwnie do insuliny. Glukoneogeneza - wytwarzanie glukozy ze związków niecukrowych, np. z mleczanu, aminokwasów i glicerolu; nasila się podczas dłuższego głodu, gdy zapas glikogenu się kończy.
21.Gen, genom, chromosom; informacja genetyczna a kod genetyczny
Gen to odcinek DNA zawierający informację o budowie jednego białka albo cząsteczki RNA, np. tRNA. Genom to całość DNA organizmu - komplet jego informacji genetycznej. Chromosom to cząsteczka DNA nawinięta na białka histonowe; człowiek ma w komórkach ciała 46 chromosomów (23 pary). Informacja genetyczna to zapisany w kolejności nukleotydów DNA przepis na białka i RNA danego organizmu - jest inna u różnych gatunków i osobników. Kod genetyczny to reguła odczytywania tej informacji: które trójki nukleotydów oznaczają które aminokwasy. Kod jest niemal taki sam u wszystkich organizmów.
22.Replikacja DNA - semikonserwatywna
Replikacja to podwojenie DNA przed podziałem komórki; u eukariontów zachodzi w jądrze, w interfazie. Enzym helikaza rozplata podwójną helisę, rozrywając wiązania wodorowe między zasadami. Każda stara nić staje się matrycą: polimeraza DNA dobudowuje do niej nową nić z wolnych nukleotydów zgodnie z regułą komplementarności (A-T, G-C). Powstają dwie identyczne cząsteczki DNA. Replikacja jest semikonserwatywna (półzachowawcza): każda nowa cząsteczka składa się z jednej nici starej i jednej nowej. Dzięki temu komórki potomne dostają taką samą informację genetyczną jak komórka macierzysta.
23.Transkrypcja: polimeraza RNA i mRNA
Transkrypcja to przepisanie informacji z DNA na RNA - pierwszy etap ekspresji genu. U eukariontów zachodzi w jądrze komórkowym. Enzym polimeraza RNA przyłącza się do początku genu (promotora), rozplata fragment DNA i na jednej nici - matrycowej - buduje komplementarną nić RNA: naprzeciw A w DNA wstawia U, naprzeciw T - A, naprzeciw G - C, a naprzeciw C - G. Powstaje mRNA (informacyjny RNA), który przenosi przepis na białko z jądra do cytoplazmy, na rybosomy. W transkrypcji powstają też tRNA i rRNA. Przykład: nić matrycowa DNA o sekwencji TAC GGA daje mRNA o sekwencji AUG CCU.
24.Eksony, introny i obróbka potranskrypcyjna
Geny eukariontów są zwykle nieciągłe: składają się z eksonów - odcinków kodujących białko, i intronów - odcinków niekodujących, które je rozdzielają. W transkrypcji powstaje pre-mRNA, czyli kopia całego genu, razem z intronami. Obróbka potranskrypcyjna zachodzi w jądrze i obejmuje: wycinanie intronów i łączenie eksonów (splicing), dołączenie „czapeczki” na początku cząsteczki i ogona poli-A (wielu nukleotydów z adeniną) na jej końcu - chronią one mRNA przed rozkładem. Dopiero dojrzały mRNA opuszcza jądro. Geny bakterii zwykle nie mają intronów, więc ich mRNA nie wymaga takiej obróbki.
25.Kod genetyczny i jego cechy
Kod genetyczny to sposób zapisu kolejności aminokwasów w białku kolejnością nukleotydów. Cechy kodu: trójkowy - jeden aminokwas wyznaczają trzy kolejne nukleotydy (kodon), możliwe są kodony; jednoznaczny - dany kodon oznacza tylko jeden aminokwas; zdegenerowany - większość aminokwasów jest kodowana przez więcej niż jeden kodon; bezprzecinkowy - między kodonami nie ma znaków rozdzielających; niezachodzący - każdy nukleotyd należy tylko do jednego kodonu; uniwersalny - prawie u wszystkich organizmów te same kodony oznaczają te same aminokwasy (z nielicznymi wyjątkami).
26.Kodon START i kodony STOP; odczytywanie sekwencji mRNA
Kodony odczytuje się z mRNA trójkami, w jednym kierunku i bez przerw. Kodon START to AUG - od niego rybosom zaczyna budowę białka; oznacza też aminokwas metioninę, więc nowy łańcuch zaczyna się od metioniny. Trzy kodony STOP: UAA, UAG i UGA nie oznaczają żadnego aminokwasu - kończą translację. Jak odczytać sekwencję: znajdź AUG, dziel dalej na trójki i każdej przypisz aminokwas z tabeli kodu genetycznego, aż trafisz na kodon STOP. Liczba aminokwasów równa się liczbie kodonów od AUG do kodonu poprzedzającego STOP. Podział sekwencji na trójki to ramka odczytu.
27.Translacja: rybosom, tRNA, antykodon
Translacja to budowanie białka według informacji z mRNA - drugi etap ekspresji genu. Zachodzi w cytoplazmie, na rybosomach. Rybosom przesuwa się wzdłuż mRNA i odczytuje kolejne kodony. Aminokwasy dostarcza tRNA: każdy tRNA niesie jeden określony aminokwas i ma antykodon - trójkę nukleotydów komplementarną do kodonu w mRNA (np. kodon AUG - antykodon UAC). Gdy antykodon dopasuje się do kodonu, rybosom łączy ten aminokwas z rosnącym łańcuchem wiązaniem peptydowym. Translacja zaczyna się od kodonu START i kończy na kodonie STOP; gotowy łańcuch zwija się i bywa jeszcze modyfikowany.
28.Ekspresja genów i jej regulacja
Ekspresja genu to odczytanie jego informacji: w transkrypcji z DNA powstaje RNA, a w translacji z mRNA - białko. Prawie wszystkie komórki ciała mają te same geny, ale w każdej działa tylko część z nich - dlatego komórka mięśniowa różni się od nerwowej. Regulacja ekspresji genów to włączanie i wyłączanie genów oraz sterowanie ilością powstającego białka, zależnie od potrzeb i sygnałów, np. hormonów. U eukariontów zachodzi na wielu etapach: przez stopień upakowania DNA, białka pobudzające lub hamujące transkrypcję, obróbkę i trwałość mRNA oraz modyfikacje gotowego białka.
29.Zmienność genetyczna (rekombinacyjna i mutacyjna) oraz środowiskowa
Zmienność to różnice w cechach (fenotypach) między osobnikami jednego gatunku. Zmienność genetyczna jest dziedziczna i ma dwa źródła. Rekombinacyjna - nowe połączenia istniejących alleli: crossing-over (wymiana odcinków między chromosomami homologicznymi w mejozie), losowy rozdział chromosomów do gamet i losowe łączenie się gamet. Mutacyjna - mutacje, czyli nagłe, trwałe zmiany w DNA; tylko one tworzą nowe allele. Zmienność środowiskowa to różnice wywołane warunkami życia, np. opalenizna albo wysokość rośliny zależna od światła i gleby. Nie zmienia DNA, więc nie jest dziedziczna.
30.Zmienność ciągła i nieciągła; średnia i rozkład cechy
Zmienność nieciągła: cecha ma kilka odrębnych wariantów, bez form pośrednich, np. grupy krwi A, B, AB i 0. Zwykle zależy od jednego genu, a środowisko prawie na nią nie wpływa. Zmienność ciągła: cecha przyjmuje wiele wartości pośrednich, np. wzrost, masa ciała. Zależy od wielu genów i od środowiska. Opisuje ją analiza statystyczna: mierzy się cechę u wielu osobników, oblicza średnią arytmetyczną (suma pomiarów podzielona przez ich liczbę) i sporządza rozkład cechy. Zwykle najwięcej osobników ma wartości bliskie średniej, a skrajnych jest mało - wykres przypomina dzwon (rozkład normalny).
31.Mutacje genowe: substytucja, delecja, insercja
Mutacja genowa to zmiana jednego lub kilku nukleotydów w genie. Substytucja - zamiana nukleotydu na inny; zmienia najwyżej jeden kodon. Skutki: mutacja cicha (nowy kodon oznacza ten sam aminokwas, bo kod jest zdegenerowany), zamiana jednego aminokwasu na inny (tak powstaje anemia sierpowata) albo powstanie kodonu STOP i skrócenie białka. Delecja - utrata nukleotydu, insercja - wstawienie dodatkowego. Gdy liczba utraconych lub wstawionych nukleotydów nie dzieli się przez 3, przesuwa się ramka odczytu: od miejsca mutacji zmieniają się wszystkie kolejne kodony, więc białko zwykle nie działa.
32.Aberracje chromosomowe strukturalne i liczbowe: zespół Downa, Turnera, Klinefeltera
Aberracje chromosomowe to zmiany budowy lub liczby chromosomów. Strukturalne: delecja (utrata fragmentu), duplikacja (podwojenie fragmentu), inwersja (odwrócenie fragmentu), translokacja (przeniesienie fragmentu na inny chromosom). Liczbowe powstają zwykle przez nierozejście się chromosomów w mejozie. Zespół Downa - trisomia 21: trzy chromosomy 21, łącznie 47. Zespół Turnera - kobieta z jednym chromosomem X (X0, 45 chromosomów): niski wzrost, zwykle niepłodność. Zespół Klinefeltera - mężczyzna z dodatkowym chromosomem X (XXY, 47 chromosomów): wysoki wzrost, zwykle niepłodność.
33.Czynniki mutagenne i transformacja nowotworowa
Czynniki mutagenne zwiększają częstość mutacji. Fizyczne: promieniowanie ultrafioletowe (UV), rentgenowskie i gamma. Chemiczne: składniki dymu tytoniowego (np. benzopiren) i kwas azotowy(III). Biologiczne: niektóre wirusy, np. wirus brodawczaka ludzkiego (HPV). Transformacja nowotworowa to przemiana zdrowej komórki w nowotworową wskutek nagromadzenia mutacji w genach, których białka regulują cykl komórkowy lub naprawiają DNA - komórka zaczyna się dzielić bez kontroli. Ryzyko zmniejszają m.in. niepalenie, ochrona skóry przed UV i szczepienie przeciw HPV.
34.Choroby jednogenowe: mukowiscydoza, fenyloketonuria, pląsawica Huntingtona, hemofilia, daltonizm
Autosomalne recesywne (choruje tylko homozygota aa, Aa to zdrowy nosiciel): mukowiscydoza - gęsty śluz zalega w płucach i przewodach trzustki; fenyloketonuria - organizm nie przekształca aminokwasu fenyloalaniny, a jej nadmiar uszkadza rozwijający się mózg, dlatego bada się noworodki. Autosomalna dominująca (wystarczy jeden zmutowany allel): pląsawica Huntingtona - postępujące uszkodzenie układu nerwowego, zwykle u dorosłych. Recesywne sprzężone z płcią (gen na chromosomie X, częściej chorują mężczyźni): hemofilia - zaburzenie krzepnięcia krwi, daltonizm - zaburzenie rozróżniania barw.
35.Genotyp, fenotyp, allele, homozygota i heterozygota; I prawo Mendla
Gen może mieć różne wersje - allele. Allel dominujący (duża litera, A) ujawnia się w fenotypie nawet wtedy, gdy jest tylko jeden; allel recesywny (mała litera, a) - tylko przy braku dominującego. Genotyp to zestaw alleli osobnika, np. AA, Aa, aa. Fenotyp to obserwowalne cechy - wynik działania genotypu i środowiska. Homozygota ma dwa jednakowe allele genu: dominująca AA, recesywna aa. Heterozygota ma dwa różne allele (Aa). I prawo Mendla (czystości gamet): cechę warunkuje para alleli genu, a do gamety trafia tylko jeden allel z pary. Heterozygota Aa wytwarza więc po połowie gamet A i a.
36.Szachownica Punnetta, stosunki 3 : 1 i 1 : 2 : 1, krzyżówka testowa
Szachownica Punnetta to tabela krzyżówki: w nagłówkach wpisuje się gamety rodziców, a w polach - genotypy potomstwa. Każde pole jest jednakowo prawdopodobne. Krzyżówka Aa x Aa daje genotypy AA, Aa, Aa, aa: stosunek genotypów 1 : 2 : 1, a fenotypów 3 : 1, czyli prawdopodobieństwo cechy recesywnej to (25%). Krzyżówka Aa x aa daje stosunek 1 : 1. Krzyżówka testowa ustala genotyp osobnika o cesze dominującej: krzyżuje się go z homozygotą recesywną aa. Cecha recesywna u potomstwa oznacza, że był heterozygotą Aa; jej brak w licznym potomstwie - że najpewniej homozygotą AA.
37.II prawo Mendla, stosunek 9 : 3 : 3 : 1 i reguła mnożenia prawdopodobieństw
II prawo Mendla (niezależnej segregacji): allele różnych genów trafiają do gamet niezależnie od siebie, jeśli geny leżą na różnych chromosomach. Podwójna heterozygota AaBb wytwarza cztery rodzaje gamet: AB, Ab, aB, ab, każdy z prawdopodobieństwem . Krzyżówka AaBb x AaBb daje stosunek fenotypów 9 : 3 : 3 : 1. Reguła mnożenia: prawdopodobieństwo jednoczesnego zajścia dwóch niezależnych zdarzeń jest iloczynem ich prawdopodobieństw. Każdy gen można więc policzyć osobno i wyniki pomnożyć: dla AaBb x AaBb szansa na potomka aabb to .
38.Prawo Hardy'ego-Weinberga: częstość alleli, genotypów i fenotypów
Prawo Hardy'ego-Weinberga opisuje populację w równowadze genetycznej: częstości alleli i genotypów nie zmieniają się w niej z pokolenia na pokolenie. Dla genu o dwóch allelach: - częstość allelu dominującego A, - częstość allelu recesywnego a. Częstość to ułamek wszystkich alleli tego genu w populacji, więc . Częstości genotypów: - homozygoty dominujące AA, - heterozygoty Aa, - homozygoty recesywne aa; razem . Częstości fenotypów: cechę dominującą ma osobników, a recesywną .
39.Warunki równowagi populacji w prawie Hardy'ego-Weinberga
Prawo Hardy'ego-Weinberga jest spełnione tylko w populacji idealnej, w której: 1) osobników jest bardzo dużo, więc przypadek nie zmienia częstości alleli (nie działa dryf genetyczny); 2) osobniki kojarzą się losowo; 3) nie zachodzą mutacje; 4) nie ma migracji; 5) nie działa dobór naturalny - wszystkie genotypy mają jednakowe szanse przeżycia i wydania potomstwa. W przyrodzie rzadko wszystkie warunki są spełnione naraz. Jeśli częstości alleli zmieniają się z pokolenia na pokolenie, populacja nie jest w równowadze, czyli ewoluuje. Prawo jest więc punktem odniesienia do wykrywania ewolucji.
40.Obliczenia z prawa Hardy'ego-Weinberga - przykład krok po kroku
Zacznij od homozygot recesywnych, bo tylko ich genotyp widać po fenotypie. Przykład: cechę recesywną ma 9% populacji. 1) . 2) - częstość allelu a. 3) - częstość allelu A. 4) Heterozygoty: , czyli 42%. 5) Homozygoty dominujące: , czyli 49%. Sprawdzenie: . Na 1000 osobników przypada 90 homozygot recesywnych, 420 heterozygot i 490 homozygot dominujących. Typowy błąd: przyjęcie - to częstość genotypu aa, nie allelu a.
Notatka
Od pierwiastka do makrocząsteczki: cztery grupy związków organicznych
Organizmy budują głównie pierwiastki biogenne: C, H, O, N, P i S. Wraz z Ca, Mg, K, Na i Cl należą one do makroelementów, a mikroelementy, np. Fe, I i F, wystarczają w bardzo małych ilościach. Środowiskiem reakcji jest woda: jej cząsteczki są polarne, dlatego dobrze rozpuszcza wiele substancji.
Duże cząsteczki powstają z małych cegiełek. Gdy tworzy się wiązanie między nimi, odłącza się cząsteczka wody, a rozkład, np. trawienie, wymaga jej przyłączenia. Łańcuch ze 100 aminokwasów ma 99 wiązań peptydowych, więc przy jego budowie powstało 99 cząsteczek wody.
- Węglowodany (C, H, O) - cegiełka: cukier prosty, np. glukoza; wiązanie glikozydowe; paliwo i zapas (skrobia, glikogen) oraz budulec (celuloza; chityna zawiera też azot). Wykrywanie skrobi: płyn Lugola barwi ją na granatowo.
- Białka (C, H, O, N, często S) - cegiełka: aminokwas z grupą aminową , grupą karboksylową i łańcuchem bocznym (u alaniny to ); wiązanie peptydowe; enzymy, budulec, transport, odporność. Wykrywanie: reakcja biuretowa - barwa fioletowa.
- Lipidy (C, H, O, w fosfolipidach także P) - tłuszcz właściwy to glicerol i trzy kwasy tłuszczowe; wiązanie estrowe; zapas energii i izolacja, a fosfolipidy budują błony komórkowe. Wykrywanie: Sudan III barwi tłuszcz na pomarańczowoczerwono.
- Kwasy nukleinowe (C, H, O, N, P) - cegiełka: nukleotyd (cukier, reszta fosforanowa, zasada azotowa); DNA przechowuje informację genetyczną, a RNA pośredniczy w jej odczytywaniu.
O właściwościach decyduje też sposób połączenia cegiełek. Skrobia i celuloza to łańcuchy glukozy, ale wiązania α w skrobi enzymy człowieka rozcinają, a wiązań β w celulozie - nie. W białku kolejność aminokwasów (struktura I-rzędowa) wyznacza zwinięcie łańcucha, czyli struktury wyższych rzędów, a kształt - funkcję. Denaturacja, np. w wysokiej temperaturze, niszczy kształt, lecz nie wiązania peptydowe: kolejność aminokwasów zostaje, a funkcja znika.
Metabolizm: ATP, przenośniki elektronów i enzymy
Katabolizm rozkłada związki złożone i uwalnia energię (oddychanie komórkowe, fermentacja), a anabolizm buduje je i energię zużywa (fotosynteza, synteza białek). Łączy je ATP - nukleotyd z adeniny, rybozy i trzech reszt fosforanowych. Działa jak akumulator: katabolizm go ładuje (ADP + fosforan → ATP), a anabolizm i praca komórki rozładowują (ATP → ADP + fosforan).
Elektrony i wodór przenoszą cząsteczki krążące między formą pustą a załadowaną:
- NAD+ i FAD odbierają je od rozkładanych związków (powstają NADH i ) i oddają w łańcuchu oddechowym;
- NADP+ odbiera je w fazie fotosyntezy zależnej od światła (powstaje NADPH) i oddaje w cyklu Calvina.
Reakcje przyspieszają enzymy - zwykle białka, które obniżają energię aktywacji i same się nie zużywają. Substrat pasuje kształtem do centrum aktywnego, stąd swoistość substratowa: laktaza rozkłada laktozę, ale nie sacharozę.
Wykresy aktywności enzymu czyta się tak:
- temperatura - krzywa rośnie do optimum, potem gwałtownie opada, bo białko enzymu ulega denaturacji; chłód tylko spowalnia reakcję;
- pH - aktywność jest największa przy wartości optymalnej i maleje po obu jej stronach;
- stężenie substratu - krzywa rośnie, aż się wypłaszcza, gdy wszystkie centra aktywne są zajęte (wysycenie).
Przykład z kuchni: galaretka ze świeżym ananasem nie tężeje, bo enzym z owocu (proteinaza) tnie białko żelatyny; z ananasem z puszki tężeje, bo ogrzewanie zdenaturowało enzym.
Inhibitor kompetycyjny przypomina substrat i zajmuje centrum aktywne, a niekompetycyjny przyłącza się w innym miejscu i zmienia kształt centrum. W sprzężeniu zwrotnym ujemnym inhibitorem jest końcowy produkt szlaku metabolicznego, czyli ciągu reakcji: gdy produktu jest dużo, hamuje enzym z początku szlaku, a gdy go ubywa, hamowanie ustaje. Cykl metaboliczny, np. cykl Krebsa, to szlak zamknięty - odtwarza związek, od którego się zaczął.
Fotosynteza i oddychanie tlenowe jako procesy przeciwstawne. Fermentacje
Równania sumaryczne obu procesów są jak lustrzane odbicia:
- fotosynteza: ;
- oddychanie tlenowe: + energia.
Fotosynteza to anabolizm: energia światła trafia do cukru. U roślin zachodzi w chloroplastach:
- faza zależna od światła (błony tylakoidów) - światło umożliwia rozkład wody: uwalnia się tlen, powstają ATP i NADPH, czyli siła asymilacyjna;
- faza niezależna od światła, czyli cykl Calvina (stroma) - z dwutlenku węgla powstaje cukier kosztem ATP i NADPH.
W chemosyntezie bakterii energii zamiast światła dostarcza utlenianie związków nieorganicznych.
Oddychanie tlenowe to katabolizm: część energii glukozy trafia do ATP (około 30-32 cząsteczek na cząsteczkę glukozy):
- glikoliza (cytozol, czyli płyn cytoplazmy) - glukoza rozpada się na 2 cząsteczki pirogronianu, zysk 2 ATP;
- reakcja pomostowa i cykl Krebsa (macierz mitochondrium) - odłącza się , powstają NADH i ;
- łańcuch oddechowy (wewnętrzna błona mitochondrium) - elektrony z NADH i trafiają na tlen, powstaje woda i najwięcej ATP.
Ważne
Rośliny oddychają przez całą dobę, we wszystkich żywych komórkach, a fotosyntezę prowadzą tylko na świetle, w komórkach z chloroplastami.
Bez tlenu łańcuch oddechowy staje i NADH nie ma gdzie oddać elektronów. W fermentacji oddaje je przy dalszej przemianie pirogronianu, dzięki czemu odtwarza się NAD+ i glikoliza trwa. W fermentacji mleczanowej (bakterie mlekowe, mięśnie przy dużym wysiłku) powstaje mleczan, w alkoholowej (drożdże) - etanol i dwutlenek węgla. Zysk to tylko 2 ATP, około 15 razy mniej niż w oddychaniu tlenowym, bo glukoza nie zostaje utleniona do końca.
Glukozą gospodaruje głównie wątroba: glikogenogeneza buduje glikogen po posiłku, glikogenoliza rozkłada go między posiłkami, a glukoneogeneza wytwarza glukozę ze związków niecukrowych, zwłaszcza podczas dłuższego głodu.
Od genu do białka: replikacja, transkrypcja, translacja
Informacja genetyczna płynie zwykle od DNA przez RNA do białka, a każdy etap opiera się na komplementarności zasad.
- Replikacja (przed podziałem komórki; u eukariontów w jądrze): helikaza rozplata helisę, a polimeraza DNA dobudowuje do każdej starej nici nową (A z T, G z C). Każda z dwóch powstałych cząsteczek ma jedną nić starą i jedną nową - replikacja jest semikonserwatywna.
- Transkrypcja (u eukariontów w jądrze): polimeraza RNA przyłącza się do promotora i na nici matrycowej DNA buduje RNA; naprzeciw A wstawia U, bo w RNA nie ma tyminy. Geny eukariontów są zwykle nieciągłe, więc z pre-mRNA wycinane są introny, a eksony łączone; czapeczka i ogon poli-A chronią dojrzały mRNA.
- Translacja (w cytoplazmie): rybosom odczytuje mRNA kodon po kodonie, a tRNA o pasującym antykodonie dostarcza właściwy aminokwas.
Przykład
Nić matrycowa DNA: TAC CTT GTA ACC ATT. Transkrypcja daje mRNA: AUG GAA CAU UGG UAA. Znaczenie kodonów: AUG - metionina (START), GAA - kwas glutaminowy, CAU - histydyna, UGG - tryptofan, UAA - STOP. Powstaje łańcuch: metionina - kwas glutaminowy - histydyna - tryptofan. Kodonów jest pięć, aminokwasów cztery, bo STOP nie oznacza żadnego. Antykodony kolejnych tRNA: UAC, CUU, GUA, ACC.
Odczyt krok po kroku: znajdź AUG, dziel dalej na trójki bez przerw i bez nakładania (to ramka odczytu), zakończ na UAA, UAG albo UGA. Typowe błędy: wpisanie T do RNA, zaczynanie od pierwszej litery zamiast od AUG, liczenie kodonu STOP jako aminokwasu.
Kod genetyczny to sama reguła odczytu - niemal taka sama u wszystkich organizmów. Informacja genetyczna to treść zapisana tym kodem, inna u różnych gatunków i osobników. U bakterii geny zwykle nie mają intronów, a transkrypcja i translacja zachodzą w cytoplazmie. O tym, które geny są w danej komórce odczytywane, decyduje regulacja ekspresji genów - dlatego komórka nerwowa różni się od mięśniowej, choć mają te same geny.
Zmienność i mutacje: co się zmienia i z jakim skutkiem
Różnice między osobnikami jednego gatunku mają trzy źródła:
- zmienność rekombinacyjna - nowe zestawienia istniejących alleli: crossing-over, losowy rozdział chromosomów do gamet i losowe łączenie się gamet;
- zmienność mutacyjna - nagłe, trwałe zmiany w DNA; tylko one tworzą nowe allele;
- zmienność środowiskowa - skutek warunków życia; nie zmienia DNA, więc nie jest dziedziczna.
Cechy zależne od jednego genu mają zwykle kilka odrębnych wariantów (zmienność nieciągła), a zależne od wielu genów i środowiska zmieniają się płynnie (zmienność ciągła, opisywana średnią i rozkładem cechy).
Mutacja genowa zmienia jeden lub kilka nukleotydów, a jej skutek zależy od losu kodonów. Dla mRNA AUG GAA CAU UGG UAA (metionina - kwas glutaminowy - histydyna - tryptofan):
- substytucja CAU na CAC - nadal histydyna: mutacja cicha;
- substytucja GAA na GUA - walina zamiast kwasu glutaminowego: zmiana jednego aminokwasu;
- substytucja UGG na UGA - kodon STOP: białko skrócone;
- delecja pierwszego G z GAA - odczyt AUG AAC AUU GGU AA: ramka odczytu się przesuwa, zmieniają się wszystkie dalsze aminokwasy (asparagina, izoleucyna, glicyna) i w tym fragmencie nie ma już kodonu STOP.
Aberracje chromosomowe zmieniają budowę chromosomów (np. delecja lub translokacja fragmentu) albo ich liczbę. Aberracje liczbowe biorą się zwykle z nierozejścia się chromosomów w mejozie: gameta ma 24 albo 22 chromosomy zamiast 23, więc po zapłodnieniu jest ich (zespół Downa - trzy chromosomy 21, zespół Klinefeltera - XXY) albo (zespół Turnera - jeden chromosom X).
Częstość mutacji zwiększają mutageny: fizyczne (np. promieniowanie UV), chemiczne (np. benzopiren z dymu tytoniowego) i biologiczne (np. wirus HPV). Nagromadzenie mutacji w genach kontrolujących podziały komórki i naprawę DNA może prowadzić do transformacji nowotworowej. Przy rozmnażaniu płciowym potomstwo dziedziczy tylko mutacje z komórek rozrodczych.
Krzyżówki genetyczne: schemat, jeden gen, krzyżówka testowa, dwa geny
Krzyżówkę rozwiązuje się w czterech krokach:
- zapisz genotypy rodziców (allel dominujący dużą literą): osobnik o cesze recesywnej to na pewno aa, a cechę dominującą ma zarówno AA, jak i Aa;
- wypisz gamety - do każdej trafia jeden allel z pary (I prawo Mendla);
- wpisz gamety w nagłówki szachownicy Punnetta i wypełnij pola; każde jest jednakowo prawdopodobne;
- policz genotypy i fenotypy i odpowiedz dokładnie na pytanie (genotyp czy fenotyp).
Przykład
U grochu łodyga wysoka (A) dominuje nad karłową (a). Krzyżówka Aa x Aa: każde z rodziców daje gamety A i a, pola to AA, Aa, Aa, aa. Genotypy 1 : 2 : 1, fenotypy 3 : 1, roślina karłowa: . Wśród samych roślin wysokich heterozygot jest - dwa pola z trzech.
Z potomstwa można wnioskować o rodzicach: stosunek 3 : 1 wskazuje na Aa x Aa, a 1 : 1 - na Aa x aa.
Krzyżówka testowa rozstrzyga, czy osobnik o cesze dominującej jest AA, czy Aa. Krzyżuje się go z homozygotą aa, która daje wyłącznie gamety a, więc fenotyp potomka zdradza allel otrzymany od badanego rodzica. Już jeden potomek o cesze recesywnej dowodzi genotypu Aa; liczne potomstwo wyłącznie o cesze dominującej przemawia za AA.
Dwa geny z różnych chromosomów dziedziczą się niezależnie (II prawo Mendla). Do gamety trafia po jednym allelu każdego genu, więc AaBb wytwarza gamety AB, Ab, aB i ab. Zamiast wypełniać 16 pól, wygodniej policzyć każdy gen osobno i wyniki pomnożyć (reguła mnożenia). W krzyżówce AaBb x AaBb każdy gen daje cechy dominującej i recesywnej, stąd:
- obie cechy dominujące: ;
- jedna dominująca, druga recesywna: (w dwóch wariantach);
- obie recesywne: .
Tak powstaje stosunek 9 : 3 : 3 : 1.
Dziedziczenie płci, cechy sprzężone z płcią i choroby jednogenowe
Płeć dziecka zależy od plemnika: komórka jajowa niesie chromosom X, a plemnik X albo Y. Szansa na chłopca wynosi więc przy każdych narodzinach, niezależnie od płci starszego rodzeństwa.
Geny z chromosomu X dziedziczą się inaczej niż geny z autosomów (chromosomów innych niż X i Y), bo mężczyzna ma tylko jeden chromosom X: pojedynczy allel recesywny od razu się u niego ujawnia (), a kobieta musiałaby mieć dwa (). Kobieta jest zdrową nosicielką. Ojciec przekazuje chromosom X wszystkim córkom, a synom - chromosom Y; syn dostaje X od matki.
Przykład: ojciec z daltonizmem () i matka . Wszystkie córki to nosicielki , a wszyscy synowie () rozróżniają barwy prawidłowo - ojciec nie przekazuje tej cechy synom.
Uwaga: gdy matka jest nosicielką, a ojciec chory, prawdopodobieństwo, że córka będzie chora, wynosi , ale że dziecko będzie chorą dziewczynką - .
Trzy sposoby dziedziczenia chorób jednogenowych:
- autosomalny recesywny (mukowiscydoza, fenyloketonuria) - choruje homozygota aa; zdrowi rodzice chorego dziecka są oboje nosicielami Aa, a prawdopodobieństwo choroby u każdego kolejnego dziecka wynosi ;
- autosomalny dominujący (pląsawica Huntingtona) - wystarcza jeden zmieniony allel; gdy jedno z rodziców ma genotyp Aa, a drugie aa, prawdopodobieństwo wynosi ;
- recesywny sprzężony z chromosomem X (hemofilia, daltonizm) - częściej dotyczy mężczyzn; zdrowi rodzice chorego syna to matka nosicielka i ojciec, który zmienionego allelu nie ma.
Gen może mieć więcej niż dwa allele: grupy krwi A, B, AB i 0 wyznaczają allele i (kodominujące - razem dają grupę AB) oraz recesywny (genotyp to grupa 0). Rodzice i mogą mieć dzieci tylko z grupą A () albo B ().
O ryzyku w konkretnej rodzinie informuje poradnia genetyczna.
Prawo Hardy'ego-Weinberga: schemat obliczeń i warunki równowagi
Prawo opisuje populację w równowadze genetycznej: częstości alleli i genotypów nie zmieniają się w niej z pokolenia na pokolenie. Dla genu o allelach A i a: to częstość allelu A, - częstość allelu a, a ponieważ innych alleli nie ma, . Gdy gamety łączą się losowo, częstości genotypów wynikają z reguły mnożenia: AA powstaje z prawdopodobieństwem , aa - , a Aa na dwa sposoby (A od matki i a od ojca albo odwrotnie), stąd . Razem .
Zadania rozwiązuje się według schematu : zaczyna się od osobników o cesze recesywnej, bo tylko ich genotyp (aa) widać po fenotypie.
Przykład
W populacji ślimaków będącej w równowadze na 500 zbadanych osobników 180 ma muszlę jasną (cecha recesywna, aa). , więc i . Heterozygoty: , czyli ślimaków. Homozygoty AA: , czyli 80 ślimaków. Sprawdzenie: .
Wynik można potwierdzić, licząc allele wprost: 500 ślimaków ma razem alleli tego genu, a alleli a jest , czyli . Wśród 320 ślimaków o muszli ciemnej aż 240 to heterozygoty - w tej populacji większość osobników o cesze dominującej ma ukryty allel recesywny.
Typowe błędy: przyjęcie odsetka osobników o cesze recesywnej za (to ), pominięcie dwójki w , uznanie odsetka osobników o cesze dominującej za (to ).
Równowaga wymaga pięciu warunków: bardzo licznej populacji (brak dryfu genetycznego), losowego kojarzenia się osobników, braku mutacji, braku migracji i braku doboru naturalnego. Gdy częstości alleli zmieniają się z pokolenia na pokolenie, któryś warunek nie jest spełniony - populacja ewoluuje.
Quizy w tym zestawie
50 pytań w 5 etapach
Odblokujesz je po dodaniu zestawu.
Sprawdzian do druku
Arkusz PDF z kluczem, punktacją i oceną
Pierwsze podejście. Klucz z punktacją i oceną jest na ostatniej stronie.
Pobierz sprawdzian (PDF)Znasz kogoś z klasy, komu się przyda? Podziel się zestawem
Podobne zestawy
36 fiszek uczy się 11
36 fiszek uczy się 5
36 fiszek uczy się 1
25 fiszek uczy się 4
32 fiszki
40 fiszek
